Coronavirus, Apa yang Dikatakan Literatur Sejauh Ini

Seorang warga mengantisipasi penularan virus corona dengan mengenakan masker. Foto Anton Muhajir.

Dirangkum GN Mahardika, Universitas Udayana Bali per 30 Januari 2020

Munculnya coronavirus baru di Wuhan, Cina, memberi tahu kita (lagi), bahwa pandemi selalu terjadi tanpa pemberitahuan. Kita tahu itu akan terjadi. Hanya saja, kita tidak pernah tahu apa yang akan menjadi pandemi, di mana dan kapan terjadi.

Sejarah pernah mencatat pandemi hebat seperti black death, Spanish flu, Asian flu, pandemi influenza H1N1/2009, dan bahkan Human Immunodeficiency Virus (HIV).

Itulah yang terjadi dengan coronavirus baru (novel coronavirus, disingkat nCoV) di Wuhan, China sejak Desember 2019. Sebagai ilmuwan dengan salah satu prinsip utama sains adalah transparansi, komunitas dunia harus memuji rilis cepat informasi genom virus dan data klinis oleh ilmuwan dan pemerintah Cina.

Itu meningkatkan transparansi pelaporan penyakit dan berbagi data. Hal ini sangat penting untuk membatasi penyebaran virus yang baru muncul ini ke bagian lain dunia (Liu dan Saif, 2020). Tidak ada ilmuwan Cina yang berbicara tentang hak kedaulatan nasional untuk isolat dan informasi, seperti yang sering kita dengar dari berbagai negara, termasuk Indonesia.

Fenomena puncak gunung es tampaknya berlaku untuk total kasus NCoV di Cina dan dunia saat ini. Jumlah kasus yang dipublikasikan bisa hanyalah puncak gunung es (a tip of an iceberg). Dalam memprediksi jumlah kasus yang dilaporkan, Nishiura dan rekan percaya bahwa jumlah kasus pada 24 Januari 2020 kemungkinan merupakan perkiraan yang terlalu rendah (Nishiura et al., 2020).

Mereka menghitung perkiraan kejadian kumulatif di China lebih dari 5.500 hingga jangka waktu itu. Ada indikasi kuat bahwa paparan yang tidak dilacak, selain yang terjadi di pasar makanan laut yang terkait secara epidemiologis di Wuhan, telah terjadi (Nishiura et al., 2020).

Penularan virus adalah dari manusia ke manusia. Perkiraan tingkat kematian akan menyerupai SARS 2002. Wu et al. menyimpulkan bahwa Informasi tentang kasus-kasus yang dilaporkan secara kuat mengindikasikan penyebaran dari manusia ke manusia, dan informasi terbaru semakin menunjukkan penularan dari manusia ke manusia yang berkelanjutan (Wu et al., 2020). Sementara keseluruhan profil keparahan di antara kasus dapat berubah karena kasus yang lebih ringan diidentifikasi, mereka memperkirakan risiko kematian di antara kasus yang dirawat di rumah sakit sebesar 14 persen (Wu et al., 2020).

Dinamika transmisi awal di Wuhan menunjukan faktor risiko kuat paparan dengan Pasar Grosir Makanan Laut Huanan yang menjual berbagai hasil laut dan peternakan dan hidupan liar. Sebagian besar kasus terkait dengan Pasar Grosir Makanan Laut Huanan (Li et al., 2020). Berbagai data klinis menunjukkan usia rata-rata adalah 59 tahun dan 56 persen adalah laki-laki (Li et al., 2020).

Masa inkubasi rata-rata adalah 5,2 hari. Angka reproduksi dasar (R0) diperkirakan 2.2 (Li et al., 2020).Virus nCoV adalah virus baru. Identitas nukleotida untuk kelelawar SARS-seperti-CoVZXC21 dan manusia SARS-CoV adalah hanya 89 persen dan 82 persen.

Angka ini terlalu rendah jika dianggap sebagai turunan langsung dua virus itu. Di samping itu, NCoV ini tampaknya telah mengalami rekombinasi dengan virus yang tidak dikenal. Pohon-pohon filogenetik orf1a / b mereka, Spike, Envelope, Membrane dan Nucleoprotein juga berkerumun erat dengan pohon-pohon koronavirus SARS kelelawar, musang dan manusia. Namun, subdomain eksternal domain pengikatan reseptor Spike pada 2019-nCoV hanya menunjukkan hanya 40 persen identitas asam amino dengan coronavirus terkait-SARS lainnya (Chan et al., 2020).

Infeksi 2019-nCoV menyebabkan kelompok penyakit pernafasan yang parah mirip dengan coronavirus sindrom pernafasan akut yang parah dan dikaitkan dengan masuknya ICU dan mortalitas tinggi (Huang et al., 2020).

Karakteristik epidemiologis, klinis, laboratorium, dan radiologis serta pengobatan dan hasil klinis adalah sebagai berikut; Sebagian besar pasien yang terinfeksi adalah laki-laki (73 persen); kurang dari setengahnya memiliki penyakit yang mendasarinya (32 persen), termasuk diabetes, hipertensi, dan penyakit kardiovaskular.

Usia rata-rata pasien yang dikonfirmasi adalah 49,0 tahun. Sebanyak 66 persen dari pasien telah terpapar ke pasar makanan laut Huanan. Gejala umum pada awal penyakit adalah demam (98 persen), batuk (76 persen), dan mialgia atau kelelahan (44 persen). Dispnea berkembang pada 55 persen pasien (waktu median dari onset penyakit menjadi dispnea 8 hari). Sebanyak 26 (63 persen) dari 41 pasien menderita limfopenia. Semua 41 pasien memiliki pneumonia dengan temuan abnormal pada CT dada.

Kematian terjadi pada orang tua. Komisi Kesehatan Nasional China melaporkan perincian 17 kematian pertama hingga 24 malam 22 Januari 2020. Kematian itu mencakup 13 pria dan 4 wanita. Usia rata-rata kematian adalah 75 (kisaran 48-89) tahun. Demam (64,7 persen) dan batuk (52,9 persen) adalah gejala pertama yang paling umum dalam kematian. Rata-rata hari dari gejala pertama hingga kematian adalah 14,0 (kisaran 6-41) hari, dan cenderung lebih pendek di antara orang-orang berusia 70 tahun atau lebih (Wang et al., 2020). [b]